За время пребывания в должности главы Национального агентства по предотвращению коррупции Александр Новиков незаконно перевел институцию в замкнутое на себя ручное управление, подменяя предусмотренные законодательством нормативно-правовые акты необязательными для выполнения методичками. Об этом пишет редактор отдела политики ZN.UA Инна Ведерникова в тексте «Итоги внешнего аудита НАПК: стратегический провал институции или Новикова?», ссылаясь на результаты внешней независимой оценки эффективности деятельности НАПК в 2020-2021 годах.
Аудиторы отметили в выводах: «Одной из наиболее проблемных практик стала подмена главой НАПК принятия обязательных к исполнению подзаконных нормативно-правовых актов так называемыми методическими рекомендациями или другими необязательными к исполнению документами«.
Такие документы не регистрировали в Минюсте, как это должно было бы происходить с нормативно-правовыми актами. Международные эксперты комиссии по оценке НАПК считают, что такая практика Новикова нарушала положения закона о предотвращении коррупции, принцип конституционной законности и другие принципы верховенства права. Все это касается ключевой институции украинского антикорблока.